В условиях развития цифровой экономики особый вклад в процесс принятия управленческих решений вносят интеллектуальные информационные системы, помогающие анализировать, обосновывать, интерпретировать и систематизировать совокупность информационных потоков, источников данных. В этой связи алгоритмизация принятия управленческих решений в цифровой экономике видится как важная научная и практическая задача для современных промышленных предприятий. В статье исследуются вопросы по разработке методической базы для алгоритмизации принятия управленческих решений в цифровой экономике. Показано, что максимизация функции управления достигается с учетом системы ограничений, включающей величину материальных потоков между объектами производственной системы и ресурсных ограничений. Обосновано, что действенным способом алгоритмизации управленческих решений в рамках производственной программы развития предприятий выступает подход, сочетающий оценки экспертов и результаты решения задач оптимизации производственной системы. Выявлено, что итогом алгоритма интеллектуальной поддержки принятия управленческого решения является решение вопросов по распределению ресурсного и результативного взаимодействия между объектами системы, разработке ключевых показателей эффективности и мониторинга их достижения.